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基因家族鉴定流程

准备

1 找到待分析基因家族

①宜从已发表的文章进行查找，基因家族有相似的保守结构域和序列片段。在基因命名上一般有着相投的字母前缀，如RabA1a、RabA1b、RabA1c、RabA1d和RabA1e。

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高等数学笔记

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初等数学———研究常量——–静止的观点

高等数学———研究变量——–运动辩证的观点—–笛卡尔的变数—–微分和积分

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启动子顺式作用元件分析

1 准备GFF,基因组Fasta文件,基因家族geneID号

2 提取启动子区域

PS:CDS,PARENT,2000,勾选retain，键入输出目录fasta

3 提取目标基因家族成员的启动子

4 检测启动子是否提取正确

5 转换所有启动子序列为大写

6 上传plantcare

7 简化tab表格数据

8 筛选目标顺式作用元件并修改

9 设置启动子显示的起始和终止位置

PS：起始位置为：第一列数字-20，终止位置为：第一列数字+第二列数字+20

10 制作序列长度文件txt

11 导入数据并绘图

12 修改图片

13 导出图片

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Arcmap行政图，区位图制作

一、获取数据（shp文件，网络搜索，微信搜索，网盘）

二、导入数据（拖入，或选择加入），加入特定经纬度坐标点，并标注

三、合并与融合

四、筛选

五、标注要素

六、附件

七、导出地图

使用软件Version ：ArcMap 10.8

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文章写作注意事项

1 基因突变体小写，蛋白大写

2 Salt over sensitive SOS 盐敏感

3 用however不用but

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海拔高程图制作

一、获取数据（DEM高程）

二、导入数据（拖入ArcMap）

三、合并TIF（工具>>>>栅格>>>>栅格数据集>>>>镶嵌至新栅格>>>>指定合并后的tif输出目录和名称，16-BIT-signed，波段为1）

四、将合并后的TIF裁剪至行政区（栅格>>>>栅格处理>>>>裁剪，勾选 使用输入要素裁剪几何，后续步骤同前行政区）

使用软件Version ：ArcMap 10.8